微生物菌群檢測(cè)摘要:微生物菌群檢測(cè)采用高通量測(cè)序和分子生物學(xué)技術(shù),分析環(huán)境、生物或工業(yè)樣本中的微生物群落結(jié)構(gòu)、組成及功能。核心檢測(cè)對(duì)象包括細(xì)菌、古菌、真菌等微生物類(lèi)群的多樣性、豐度和相互作用。關(guān)鍵項(xiàng)目涵蓋Alpha多樣性指數(shù)(如Shannon指數(shù))、Beta多樣性距離(如Bray-Curtis)、物種相對(duì)豐度、功能基因預(yù)測(cè)(如KEGG通路),以及病原體篩查和耐藥基因檢測(cè),確保群落生態(tài)評(píng)估的準(zhǔn)確性和可比性。
參考周期:常規(guī)試驗(yàn)7-15工作日,加急試驗(yàn)5個(gè)工作日。
注意:因業(yè)務(wù)調(diào)整,暫不接受個(gè)人委托測(cè)試,望諒解(高校、研究所等性質(zhì)的個(gè)人除外)。
Alpha多樣性分析:
1. 土壤樣本:涵蓋農(nóng)田、林地土壤,重點(diǎn)檢測(cè)微生物多樣性指數(shù)及重金屬耐受菌豐度
2. 水質(zhì)樣本:包括飲用水、廢水,側(cè)重病原微生物篩查及生物膜群落結(jié)構(gòu)分析
3. 人體腸道樣本:聚焦糞便微生物,檢測(cè)厚壁菌/擬桿菌比例及抗生素耐藥基因攜帶率
4. 口腔微生物樣本:分析唾液生物膜,重點(diǎn)檢測(cè)鏈球菌屬豐度及齲齒相關(guān)菌群
5. 食品發(fā)酵樣本:如酸奶、泡菜,檢測(cè)乳酸桿菌活性及腐敗微生物污染水平
6. 工業(yè)廢水樣本:涉及生物處理系統(tǒng),關(guān)注硝化菌功能基因及毒性物質(zhì)降解菌群
7. 空氣微生物樣本:涵蓋室內(nèi)外空氣,檢測(cè)細(xì)菌/真菌濃度及過(guò)敏原分布
8. 植物根際樣本:針對(duì)作物根系,重點(diǎn)分析促生菌豐度及病原真菌抑制率
9. 動(dòng)物糞便樣本:包括畜禽排泄物,檢測(cè)耐藥基因傳播風(fēng)險(xiǎn)及消化菌群組成
10. 生物膜樣本:如管道表面生物膜,聚焦群落三維結(jié)構(gòu)及抗生物膜效能評(píng)估
國(guó)際標(biāo)準(zhǔn):
檢測(cè)方法差異說(shuō)明:ISO標(biāo)準(zhǔn)優(yōu)先使用宏基因組全長(zhǎng)測(cè)序,而GB標(biāo)準(zhǔn)側(cè)重16S rRNA靶向擴(kuò)增,導(dǎo)致物種分辨率不同;樣本前處理差異,ISO要求凍干保存,GB采用常溫運(yùn)輸。
1. 高通量測(cè)序儀:Illumina NovaSeq 6000(通量20B reads/run,讀長(zhǎng)2x150bp)
2. 實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀:Thermo Fisher QuantStudio 5(檢測(cè)通道6色,精度±0.1 Cq)
3. DNA提取儀:Qiagen QIAcube HT(吞吐量96樣本/批,純度A260/A280≥1.8)
4. 生物分析儀:Agilent 2100(片段大小檢測(cè)50bp-7000bp,精度±1%)
5. 離心機(jī):Eppendorf 5430R(轉(zhuǎn)速30000 rpm,溫控范圍-10°C至40°C)
6. 分光光度計(jì):NanoDrop One(核酸檢測(cè)范圍2-3700 ng/μL,分辨率0.1 ng/μL)
7. 恒溫培養(yǎng)箱:Memmert IN110(溫度范圍0°C-70°C,均勻度±0.5°C)
8. 顯微鏡:Olympus BX53(放大倍數(shù)1000X,分辨率0.2μm)
9. 厭氧工作站:Don Whitley DG250(氧濃度控制<0.1%,濕度控制80%)
10. 質(zhì)譜儀:Bruker timsTOF Pro(質(zhì)量精度<1ppm,掃描速度100Hz)
11. 酶標(biāo)儀:BioTek Synergy H1(檢測(cè)波長(zhǎng)200-1000nm,動(dòng)態(tài)范圍4OD)
12. 流式細(xì)胞儀:BD FACSAria III(流速12μL/min,檢測(cè)通道18色)
13. 核酸電泳儀:Bio-Rad PowerPac Basic(電壓范圍10-300V,電流0-400mA)
14. 生物發(fā)光檢測(cè)儀:Promega GloMax(靈敏度0.1 fmol ATP,線性范圍6 logs)
15. 恒溫振蕩器:New Brunswick Innova 44(轉(zhuǎn)速50-500 rpm,容量4L)
報(bào)告:可出具第三方檢測(cè)報(bào)告(電子版/紙質(zhì)版)。
檢測(cè)周期:7~15工作日,可加急。
資質(zhì):旗下實(shí)驗(yàn)室可出具CMA/CNAS資質(zhì)報(bào)告。
標(biāo)準(zhǔn)測(cè)試:嚴(yán)格按國(guó)標(biāo)/行標(biāo)/企標(biāo)/國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)檢測(cè)。
非標(biāo)測(cè)試:支持定制化試驗(yàn)方案。
售后:報(bào)告終身可查,工程師1v1服務(wù)。
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