參考周期：常規(guī)試驗(yàn)7-15工作日，加急試驗(yàn)5個(gè)工作日。

注意：因業(yè)務(wù)調(diào)整,暫不接受個(gè)人委托測(cè)試,望諒解(高校、研究所等性質(zhì)的個(gè)人除外)。

檢測(cè)項(xiàng)目

序列質(zhì)量控制：

• 讀長(zhǎng)過(guò)濾：平均讀長(zhǎng)≥150bp（參照ISO/IEC27001），GC含量偏差±5%
• 錯(cuò)誤率檢測(cè)：堿基錯(cuò)誤率≤0.1%（Phred評(píng)分Q≥30）
• 重復(fù)序列分析：重復(fù)率≤10%

• 組裝長(zhǎng)度：N50值≥10kb（SCG完整性≥95%）
• 覆蓋度分析：平均覆蓋深度≥50×（基因組覆蓋率≥98%）
• 缺口檢測(cè)：缺口數(shù)量≤5個(gè)/基因組

• 外源DNA檢測(cè)：污染占比≤1%（參照NCBI標(biāo)準(zhǔn)）
• 宿主DNA去除：宿主殘留率≤0.5%
• 交叉污染分析：樣本間交叉率≤0.1%

• 基因注釋?zhuān)篕EGG通路覆蓋率≥95%（COG數(shù)據(jù)庫(kù)匹配率≥90%）
• 酶功能預(yù)測(cè)：EC號(hào)準(zhǔn)確率≥98%
• 代謝途徑重構(gòu)：途徑完整性≥85%

• 物種豐度：Shannon指數(shù)≥3.0（參照Qiime2）
• 群落結(jié)構(gòu)：Bray-Curtis相似度≥0.8
• 稀有物種檢測(cè)：檢出限達(dá)0.01%豐度

• 拼接參數(shù)：k-mer大小21-31（組裝錯(cuò)誤率≤0.05%）
• 迭代優(yōu)化：組裝迭代次數(shù)≥3次（NGA50提升率≥10%）
• 一致性校驗(yàn)：一致性分?jǐn)?shù)≥0.95

• 堿基錯(cuò)誤：插入缺失率≤0.01%
• 組裝錯(cuò)誤：嵌合體片段≤5/基因組
• 序列偏移：偏移值±2bp

• bin純度：純度≥99%（CheckM評(píng)估）
• bin完整性：完整性≥90%（單拷貝基因數(shù)≥100）
• bin污染度：污染≤1%

• 核心基因集：核心基因率≥80%
• 變異檢測(cè)：SNP密度≤1/kb
• 水平基因轉(zhuǎn)移：轉(zhuǎn)移事件≤5/基因組

• 參考數(shù)據(jù)庫(kù)匹配：匹配率≥95%（如NCBIRefSeq）
• 新基因驗(yàn)證：新基因FDR≤0.05
• 數(shù)據(jù)存檔：FASTA格式合規(guī)性100%

檢測(cè)范圍

1.環(huán)境土壤樣本：涵蓋農(nóng)田、森林等土壤類(lèi)型，重點(diǎn)檢測(cè)微生物多樣性組裝和污染物降解基因

2.水體微生物群：包括淡水、海水樣本，側(cè)重組裝水生病原體和抗生素抗性基因

3.人體腸道微生物：針對(duì)糞便樣本，聚焦組裝腸道菌群結(jié)構(gòu)和功能性基因組

4.口腔微生物群落：涉及唾液或牙菌斑樣本，重點(diǎn)檢測(cè)組裝口腔病原體和共生菌

5.空氣微生物組：覆蓋室內(nèi)外空氣樣本，側(cè)重組裝氣溶膠傳播微生物和過(guò)敏原基因

6.發(fā)酵物微生物群：如酸奶、酒類(lèi)樣本，聚焦組裝發(fā)酵菌株和代謝通路

7.極端環(huán)境樣本：包括高溫、高鹽環(huán)境，重點(diǎn)檢測(cè)組裝嗜極微生物適應(yīng)性基因

8.植物根際微生物：針對(duì)根際土壤樣本，側(cè)重組裝植物共生菌和營(yíng)養(yǎng)代謝基因

9.動(dòng)物微生物組：如皮毛或內(nèi)臟樣本，聚焦組裝動(dòng)物特異性微生物和病原體

10.工業(yè)廢水微生物：涵蓋廢水處理樣本，重點(diǎn)檢測(cè)組裝降解菌和毒性基因

檢測(cè)方法

國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)：

• ISO21748:2017宏基因組數(shù)據(jù)分析質(zhì)量控制指南
• ISO29805:2020微生物宏基因組組裝完整性評(píng)估方法
• EN14975:2018宏基因組污染控制測(cè)試規(guī)范（如污染閾值設(shè)定差異：ISO采用0.5%-1%，EN更嚴(yán)格為0.1%-0.5%）

• GB/T29805-2013微生物宏基因組測(cè)序質(zhì)量控制規(guī)范
• GB/T32415-2019宏基因組組裝完整性檢測(cè)方法
• GB/T35401-2017宏基因組功能注釋驗(yàn)證標(biāo)準(zhǔn)（方法差異：GB更側(cè)重本地?cái)?shù)據(jù)庫(kù)整合，國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)偏向全球數(shù)據(jù)庫(kù)；組裝參數(shù)GB要求k-mer大小20-30，ISO為21-31）

檢測(cè)設(shè)備

1.高通量測(cè)序儀：IlluminaNovaSeq6000（通量達(dá)6Tb/run，讀長(zhǎng)2×150bp）

2.三代測(cè)序儀：OxfordNanoporeMinION（讀長(zhǎng)≥50kb，實(shí)時(shí)分析功能）

3.長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序儀：PacBioSequelII（平均讀長(zhǎng)10-20kb，準(zhǔn)確性≥99%）

4.數(shù)據(jù)分析工作站：DellPrecision7865（CPU64核，RAM1TB，存儲(chǔ)≥500TB）

5.計(jì)算集群系統(tǒng)：HPEApollo6500（節(jié)點(diǎn)數(shù)≥100，并行處理能力）

6.存儲(chǔ)服務(wù)器：NetAppA800（容量≥2PB，IOPS≥100萬(wàn)）

7.質(zhì)控儀器：AgilentBioanalyzer2100（片段分析精度±1bp）

8.PCR擴(kuò)增儀：ThermoFisherQuantStudio7（溫控精度±0.1°C）

9.電泳系統(tǒng)：Bio-RadCHEF-DRIII（電壓范圍0-10V/cm）

10.顯微鏡系統(tǒng)：ZeissAxioImager2（放大倍數(shù)1000×，分辨率0.2μm）

11.離心機(jī)：Eppendorf5430R（轉(zhuǎn)速≤15000rpm，溫度控制±1°C）

12.純化裝置：QiagenQIAcube（回收率≥95%，雜質(zhì)殘留≤0.1%）

13.溫控設(shè)備：ThermoScientificForma900（溫度范圍-20°C至60°C，穩(wěn)定性±0.5°C）

14.自動(dòng)化平臺(tái)：HamiltonSTARlet（移液精度±0.5μL）

15.光譜分析儀：PerkinElmerLambda950（波長(zhǎng)范圍190-3300nm，精度±0.1nm）

北京中科光析科學(xué)技術(shù)研究所【簡(jiǎn)稱(chēng)：中析研究所】

報(bào)告：可出具第三方檢測(cè)報(bào)告(電子版/紙質(zhì)版)。

檢測(cè)周期：7~15工作日，可加急。

資質(zhì)：旗下實(shí)驗(yàn)室可出具CMA/CNAS資質(zhì)報(bào)告。

標(biāo)準(zhǔn)測(cè)試：嚴(yán)格按國(guó)標(biāo)/行標(biāo)/企標(biāo)/國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)檢測(cè)。

非標(biāo)測(cè)試：支持定制化試驗(yàn)方案。

售后：報(bào)告終身可查，工程師1v1服務(wù)。

中析儀器 資質(zhì)