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分子病理學(xué)靶點(diǎn)定位測(cè)定

2025-07-30 關(guān)鍵詞:分子病理學(xué)靶點(diǎn)定位測(cè)定測(cè)試標(biāo)準(zhǔn),分子病理學(xué)靶點(diǎn)定位測(cè)定項(xiàng)目報(bào)價(jià),分子病理學(xué)靶點(diǎn)定位測(cè)定測(cè)試周期 相關(guān):
分子病理學(xué)靶點(diǎn)定位測(cè)定

分子病理學(xué)靶點(diǎn)定位測(cè)定摘要:分子病理學(xué)靶點(diǎn)定位測(cè)定是通過(guò)分子生物學(xué)技術(shù)對(duì)腫瘤及相關(guān)疾病組織、細(xì)胞或體液中的特定基因、蛋白質(zhì)或核酸靶點(diǎn)進(jìn)行精準(zhǔn)空間定位與定量分析的核心技術(shù),核心對(duì)象包括驅(qū)動(dòng)基因突變位點(diǎn)、癌基因/抑癌基因表達(dá)產(chǎn)物、基因拷貝數(shù)變異(CNV)及融合基因等,關(guān)鍵項(xiàng)目涵蓋靶點(diǎn)表達(dá)定位、突變類(lèi)型鑒定、拷貝數(shù)變化分析等,為臨床靶向治療、預(yù)后評(píng)估及生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)提供重要分子依據(jù)。

參考周期:常規(guī)試驗(yàn)7-15工作日,加急試驗(yàn)5個(gè)工作日。

注意:因業(yè)務(wù)調(diào)整,暫不接受個(gè)人委托測(cè)試,望諒解(高校、研究所等性質(zhì)的個(gè)人除外)。

檢測(cè)項(xiàng)目

基因靶點(diǎn)定位檢測(cè):

  • 熒光原位雜交(FISH):靶點(diǎn)基因拷貝數(shù)(信號(hào)數(shù)/細(xì)胞,參照ASTME2363-19)、融合基因斷裂位點(diǎn)定位(雙色探針重疊率≥80%)
  • 原位聚合酶鏈反應(yīng)(insituPCR):目標(biāo)基因片段擴(kuò)增產(chǎn)物定位(細(xì)胞內(nèi)信號(hào)分布)、突變位點(diǎn)空間定位(突變型探針雜交信號(hào)強(qiáng)度)
蛋白質(zhì)靶點(diǎn)定位檢測(cè):
  • 免疫組織化學(xué)(IHC):目標(biāo)蛋白表達(dá)定位(細(xì)胞定位:胞核/胞質(zhì)/胞膜)、表達(dá)強(qiáng)度評(píng)分(H-score:0-300,參照ASCO/CAP指南)
  • 免疫熒光(IF):蛋白共定位分析(兩種靶點(diǎn)熒光信號(hào)重疊系數(shù)≥0.7)、磷酸化蛋白激活狀態(tài)定位(磷酸化位點(diǎn)特異性抗體染色)
核酸靶點(diǎn)定量檢測(cè):
  • 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR):靶基因mRNA表達(dá)量(Ct值≤35,相對(duì)定量:2^-ΔΔCt)、microRNA表達(dá)水平(ΔCt值差異≥2倍)
  • 數(shù)字PCR(dPCR):突變等位基因頻率(MAF,≥0.1%)、循環(huán)游離DNA(cfDNA)靶點(diǎn)濃度(copies/μL)
突變位點(diǎn)鑒定:
  • Sanger測(cè)序:?jiǎn)魏塑账嶙儺悾⊿NV)位點(diǎn)(如EGFRexon19缺失、ALKL1196M)、插入/缺失突變(indel)長(zhǎng)度(±1bp)
  • 下一代測(cè)序(NGS):高頻突變位點(diǎn)覆蓋度(≥1000×)、突變豐度(≥1%)
融合基因檢測(cè):
  • RNA-seq:融合基因轉(zhuǎn)錄本序列(覆蓋融合斷點(diǎn)≥50bp)、融合基因表達(dá)量(TPM≥1)
  • 反轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR):融合基因產(chǎn)物長(zhǎng)度(±2bp)、融合類(lèi)型(順式/反式融合)
拷貝數(shù)變異分析:
  • 陣列比較基因組雜交(array-CGH):基因拷貝數(shù)變異(CNV)片段大?。ā?0kb)、拷貝數(shù)變化倍數(shù)(≥2倍或≤0.5倍)
  • 多重連接依賴(lài)探針擴(kuò)增(MLPA):靶基因拷貝數(shù)(±1copy)、拷貝數(shù)變異區(qū)域定位(染色體臂水平)
甲基化狀態(tài)檢測(cè):
  • 亞硫酸氫鹽測(cè)序:CpG島甲基化率(≥5%)、甲基化位點(diǎn)分布(啟動(dòng)子區(qū)域)
  • 甲基化特異性PCR(MSP):甲基化等位基因比例(≥10%)
microRNA靶點(diǎn)驗(yàn)證:
  • 雙熒光素酶報(bào)告基因assay:靶基因3'UTR結(jié)合位點(diǎn)驗(yàn)證(熒光活性降低≥50%)、microRNA-mRNA相互作用強(qiáng)度(相對(duì)熒光值比值)
  • RNA免疫沉淀(RIP):結(jié)合靶mRNA的microRNA富集倍數(shù)(≥2倍)
循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)靶點(diǎn)檢測(cè):
  • CTC表面標(biāo)志物定位:EpCAM(細(xì)胞膜定位)、CK19(胞質(zhì)定位)
  • CTC內(nèi)靶點(diǎn)基因檢測(cè):EGFR突變(exon19缺失)、HER2擴(kuò)增(拷貝數(shù)≥6)
  • CTC計(jì)數(shù)與靶點(diǎn)共定位:CTC數(shù)量(≥1個(gè)/7.5mL血液)、靶點(diǎn)表達(dá)陽(yáng)性率(≥20%)
外泌體靶點(diǎn)分析:
  • 外泌體表面蛋白靶點(diǎn):PD-L1(表達(dá)量,流式細(xì)胞術(shù)MFI值)、CD63(陽(yáng)性率≥80%)
  • 外泌體內(nèi)核酸靶點(diǎn):circRNA表達(dá)量(qPCRCt值≤38)、突變型DNA片段(數(shù)字PCRMAF≥0.01%)
融合基因轉(zhuǎn)錄本定位:
  • RNA原位雜交(RNA-ISH):融合基因轉(zhuǎn)錄本空間定位(細(xì)胞內(nèi)顆粒狀信號(hào))、表達(dá)水平評(píng)分(信號(hào)密度:1-4級(jí))
  • 單細(xì)胞RNA-seq:?jiǎn)蝹€(gè)細(xì)胞內(nèi)融合基因轉(zhuǎn)錄本(UMI計(jì)數(shù)≥5)、融合斷點(diǎn)序列(覆蓋≥10個(gè)reads)

檢測(cè)范圍

1.腫瘤組織標(biāo)本:涵蓋肺癌、乳腺癌、結(jié)腸癌等常見(jiàn)惡性腫瘤手術(shù)/活檢組織,重點(diǎn)檢測(cè)驅(qū)動(dòng)基因突變(如EGFR、ALK)及蛋白靶點(diǎn)(如PD-L1)的空間定位與表達(dá)水平

2.細(xì)胞系標(biāo)本:腫瘤細(xì)胞系(如A549、MCF-7)及正常對(duì)照細(xì)胞系,側(cè)重靶點(diǎn)基因拷貝數(shù)變異(CNV)及融合基因(如EML4-ALK)的鑒定

3.血液標(biāo)本:外周血、骨髓血等,重點(diǎn)檢測(cè)循環(huán)游離DNA(cfDNA)中的突變位點(diǎn)(如KRASG12C)及循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)表面標(biāo)志物(如EpCAM)

4.體液標(biāo)本:胸腔積液、腹水、腦脊液等,側(cè)重外泌體靶點(diǎn)(如miR-21)及脫落細(xì)胞內(nèi)蛋白靶點(diǎn)(如CA125)的定位與定量

5.穿刺標(biāo)本:肝穿刺、腎穿刺等小組織標(biāo)本,重點(diǎn)檢測(cè)癌基因(如MYC)擴(kuò)增及抑癌基因(如p53)突變的空間分布

6.石蠟包埋標(biāo)本(FFPE):archival組織標(biāo)本,側(cè)重靶點(diǎn)基因甲基化狀態(tài)(如MGMT啟動(dòng)子甲基化)及蛋白表達(dá)(如HER2)的回顧性分析

7.新鮮冰凍標(biāo)本:手術(shù)新鮮組織冰凍切片,重點(diǎn)檢測(cè)融合基因(如ROS1)的原位雜交信號(hào)及蛋白靶點(diǎn)(如VEGF)的免疫熒光定位

8.尿液標(biāo)本:尿液沉渣及尿液外泌體,側(cè)重膀胱癌相關(guān)靶點(diǎn)(如FGFR3突變)及microRNA(如miR-155)的檢測(cè)

9.唾液標(biāo)本:唾液外泌體及脫落細(xì)胞,重點(diǎn)檢測(cè)口腔癌相關(guān)靶點(diǎn)(如HPVE6/E7mRNA)及基因拷貝數(shù)變異(如CCND1擴(kuò)增)

10.腦脊液標(biāo)本:神經(jīng)腫瘤患者腦脊液,側(cè)重循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)靶點(diǎn)(如GFAP)及融合基因(如NTRK1)的檢測(cè)

檢測(cè)方法

國(guó)際標(biāo)準(zhǔn):

  • ISO15189:2022醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量和能力要求(涵蓋分子病理學(xué)檢測(cè)的質(zhì)量管理,包括方法驗(yàn)證、結(jié)果報(bào)告等環(huán)節(jié))
  • ASTME2363-19熒光原位雜交(FISH)檢測(cè)基因拷貝數(shù)變異的標(biāo)準(zhǔn)指南(規(guī)定了FISH檢測(cè)的樣本處理、探針設(shè)計(jì)及信號(hào)判讀標(biāo)準(zhǔn))
  • CLSIC24-A4臨床分子生物學(xué)檢測(cè)的質(zhì)量保證(提供了PCR、測(cè)序等分子檢測(cè)方法的驗(yàn)證流程及室內(nèi)質(zhì)控要求)
國(guó)家標(biāo)準(zhǔn):
  • GB/T35029-2018分子病理診斷技術(shù)規(guī)范(明確了基因檢測(cè)、免疫組化等方法的操作步驟及結(jié)果判讀標(biāo)準(zhǔn))
  • GB/T21767-2008臨床實(shí)驗(yàn)室定量測(cè)定室內(nèi)質(zhì)量控制指南(適用于核酸定量檢測(cè)的室內(nèi)質(zhì)控規(guī)則,如1-3s規(guī)則)
  • WS/T766-2020新型冠狀病毒肺炎實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)指南(參考了分子檢測(cè)的樣本處理、核酸提取及PCR擴(kuò)增流程)
方法差異說(shuō)明:ASTME2363-19與GB/T35029-2018在FISH檢測(cè)的信號(hào)判讀標(biāo)準(zhǔn)上存在差異,ASTM要求每個(gè)樣本至少計(jì)數(shù)200個(gè)細(xì)胞,而GB/T35029要求至少計(jì)數(shù)100個(gè)細(xì)胞;CLSIC24-A4與GB/T21767在PCR檢測(cè)的室內(nèi)質(zhì)控規(guī)則上,CLSI推薦使用Westgard多規(guī)則(1-2s、2-2s等),而GB/T21767允許使用簡(jiǎn)化的1-3s規(guī)則。

檢測(cè)設(shè)備

1.熒光原位雜交儀:雅培VysisPathVysion(檢測(cè)通道:4色熒光,分辨率:≤100kb)

2.免疫組化染色儀:羅氏BenchMarkJianCeTRA(染色速度:60分鐘/批,抗體加載精度:±1μL)

3.實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀:AppliedBiosystemsQuantStudio7Flex(檢測(cè)通道:6色,靈敏度:1copy/μL)

4.下一代測(cè)序儀:IlluminaNovaSeq6000(讀長(zhǎng):150bppaired-end,通量:1.2Tb/run)

5.數(shù)字PCR儀:Bio-RadQX200(檢測(cè)通道:2色,分辨率:0.01%突變豐度)

6.激光掃描共聚焦顯微鏡:蔡司LSM900(物鏡:63×油鏡,分辨率:≤200nm)

7.流式細(xì)胞儀:BDFACSAriaIII(檢測(cè)參數(shù):18色熒光,分選純度:≥98%)

8.亞硫酸氫鹽測(cè)序儀:ThermoFisherIonS5XL(讀長(zhǎng):400bp,覆蓋度:≥100×)

9.多重連接依賴(lài)探針擴(kuò)增儀:MRC-HollandSALSAMLPA(檢測(cè)位點(diǎn):≤45個(gè)/反應(yīng),靈敏度:±1copy)

10.外泌體分離系統(tǒng):ThermoFisherTotalExosomeIsolation(回收率:≥80%,純度:CD63陽(yáng)性率≥90%)

11.循環(huán)腫瘤細(xì)胞捕獲儀:CellSearchSystem(捕獲效率:≥80%,檢測(cè)限:1個(gè)CTC/7.5mL血液)

12.甲基化特異性PCR儀:Bio-RadCFX96(檢測(cè)通道:4色,重復(fù)性:CV≤5%)

13.RNA-seq文庫(kù)制備系統(tǒng):IlluminaNexteraXT(文庫(kù)片段大?。?00-500bp,產(chǎn)量:≥10ng/μL)

14.免疫熒光染色儀:LeicaBondMax(染色周期:30-90分鐘,抗體交叉污染率:≤0.1%)

15.微陣列芯片掃描儀:AgilentSureScan(分辨率:2μm,動(dòng)態(tài)范圍:0-65535)

北京中科光析科學(xué)技術(shù)研究所【簡(jiǎn)稱(chēng):中析研究所】

報(bào)告:可出具第三方檢測(cè)報(bào)告(電子版/紙質(zhì)版)。

檢測(cè)周期:7~15工作日,可加急。

資質(zhì):旗下實(shí)驗(yàn)室可出具CMA/CNAS資質(zhì)報(bào)告。

標(biāo)準(zhǔn)測(cè)試:嚴(yán)格按國(guó)標(biāo)/行標(biāo)/企標(biāo)/國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)檢測(cè)。

非標(biāo)測(cè)試:支持定制化試驗(yàn)方案。

售后:報(bào)告終身可查,工程師1v1服務(wù)。

中析儀器 資質(zhì)

中析分子病理學(xué)靶點(diǎn)定位測(cè)定 - 由于篇幅有限,僅展示部分項(xiàng)目,如需咨詢(xún)?cè)敿?xì)檢測(cè)項(xiàng)目,請(qǐng)咨詢(xún)?cè)诰€工程師

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